Các bị can bị đề nghị truy tố gồm: Trịnh Trọng Trung (SN 1976), thủ kho vật chứng Cục THADS TP. Hà Nội); Đinh Đức Hiền (SN 1988, trú tại xã Kiêu Kỵ, Gia Lâm, Hà Nội), kinh doanh bán hàng qua mạng; Lê Công Thắng (SN 1983) và Vũ Thái (SN 1980), nhân viên bảo vệ.
Theo kết luận, do mặt hàng thuốc lá ngoại, cigar xì gà không còn diện phải xử lý hình sự với tội Buôn bán hàng cấm nên Công an Hà Nội đình chỉ điều tra vụ án, bị can chủ lô hàng Hoàng Minh Cương. Ngày 28/12/2017, Công an Hà Nội yêu cầu Trung bàn giao số tang vật quản lý.
Thấy Trung không thể bàn giao tang vật, đưa ra nhiều lý do, ngày 9/1/2018, Phòng CSKT - Công an TP Hà Nội đã phối hợp với Cục THADS TP Hà Nội tiến hành kiểm tra kho vật chứng. Kết quả cho thấy 1.999 bao thuốc lá ngoại và 14.570 điếu xì gà các loại đã biến mất.
Qua tài liệu thu thập được và kết quả điều tra, Cơ quan CSĐT - Công an TP Hà Nội đã khởi tố vụ án hình sự về tội “Lợi dụng chức vụ trong khi thi hành công vụ”.
Ngày 17/1/2018, Công an TP Hà Nội tiếp tục kiểm tra hàng hóa trong kho vật chứng phần tang vật của vụ án Nguyễn Mạnh Tuấn phạm tội “Buôn lậu”. Kết quả kiểm tra xác định thiếu 988/991 ống kính máy ảnh Canon và Nikon.
Căn cứ tài liệu thu thập được qua kiểm tra lần thứ 2 kho vật chứng vẫn do Trịnh Trọng Trung quản lý, Cơ quan CSĐT quyết định bổ sung quyết định khởi tố vụ án hình sự về tội “Tham ô tài sản” và quyết định khởi tố bị can, bắt tạm giam đối với Trịnh Trọng Trung.
Hồ sơ và đối tượng của vụ án đã được Cơ quan CSĐT - Công an TP Hà Nội chuyển đến Cơ quan điều tra - Viện KSND tối cao để điều tra theo thẩm quyền và quy định của pháp luật.
Cơ quan điều tra - Viện KSND tối cao đã kiểm tra thêm, phát hiện thiếu 726 máy ảnh và máy quay phim, hơn 2.000 chiếc đồng hồ các loại, 1.334 chiếc USB và nhiều hàng điện tử khác…
Điều tra mở rộng vụ án, Cơ quan điều tra - Viện KSND tối cao đã khởi tố và bắt thêm 3 bị can, gồm: Đinh Đức Hiền, Lê Công Thắng và Vũ Thái. Các đối tượng khai nhận người cầm đầu, chủ mưu thực hiện hành vi gian lận là Trịnh Trọng Trung.
Cơ quan tố tụng xác định, trong thời gian từ năm 2017 đến tháng 1/2018, nhận thấy kho vật chứng có nhiều hàng hóa dễ tiêu thụ và giá trị cao, Trung đã bàn bạc, thống nhất với các đối tượng để “rút ruột”, đưa ra thị trường bán lấy tiền ăn tiêu.
Trung đã giao chìa khóa kho vật chứng cho 2 bảo vệ Thái và Thắng để những người này tự mở khóa kho vật chứng lấy hàng hóa đưa ra ngoài.
Cơ quan điều tra - Viện KSND tối cao xác định, thuốc lá ngoại, xì gà, 1 xe ô tô con cùng 1.132 chai rượu ngoại, 1.105 chai bia ngoại do một mình thủ kho Trung lấy và chiếm hưởng. Tổng số tang vật tại kho vật chứng bị “rút ruột” được cơ quan chức năng giám định có trị giá hơn 17 tỷ đồng.